病巣からとり出した膿や痰や尿、便などの検体を調べ、結核や赤痢などの感染症にかかっていないかどうかを判定する検査です。検体を染色して顕微鏡で観察したり、培地に接種・培養して細菌の種類を調べます。また、その菌にどのような薬剤が有効かも合わせて検査し治療に活用します。

大腸菌O157の検査の具体的な方法

• 便を培養します。
• 翌日にコロニーを観察して大腸菌の疑いがあるときは、確認倍地で再度、培養します。
• 翌日に試薬を使い、大腸菌を同定します。
• 血清型凝集テストを行い、ふるいをかけます。　病原性の可能性があるときは、もう一度テストをします。
• O157の可能性がある場合、詳しい血清型テストを行います。
• O157と同定します。
• O157と判定しても病原性の有無が分からないため、鞭毛抗原のH7をさらに調べます。

主に喀痰を材料とし、顕微鏡検査や培養検査により結核菌などの抗酸菌を検出する検査です。

胃潰瘍などの原因となるヘリコバクターピロリ菌の有無を検査します。

• 肝炎ウイルスマーカー
  ウイルス性肝炎の診断には、肝炎ウイルスマーカーを使用します。これによりA型、B型、C型肝炎等の肝炎関係に感染しているかどうかが分かります。
• HIV抗体
  エイズウイルス（HIV）が体内に侵入したかどうかを、血液中のHIV抗体の有無により、エイズ（後天性免疫不全症候群）の感染者かどうかを調べます。
• 梅毒血清反応
  血清中にスピロヘータ・パリダによる抗体の有無を調べます。抗生物質が治療薬として有効であることが判明したため患者数は激減しましたが、現在でも潜在的な感染者は多いと言われています。
• クラミジア・トラコマチス検査
  クラミジア感染症は若者を中心に増加しています。クラミジア・トラコマチスという病原微生物が原因で、検査は男性の尿道や女性の膣からの分泌物を使って酵素抗体法で抗原を直接検出します。

体に腫瘍ができたときに、血液中や排泄物中に、たんぱく質や酵素、ホルモンなどの増加した特別な物質を腫瘍マーカーと言います。腫瘍の種類や発症部位に特有の物質と、そうでないものがあり、それを検出するのが腫瘍マーカー検査です。腫瘍の発生やその種類、進行度などを判断する材料になります。

血液中の抗体の量を測定して、アレルギーの可能性を調べる血液検査や、アレルゲンとして疑われるものを皮膚に一定時間貼り付ける皮膚検査などがあります。

• リウマチ因子
  体の防御反応として作られた免疫グロブリンに対する自己抗体です。血清中のリウマチ因子の有無を調べることで、慢性関節リウマチの診断に活用します。
• 抗核抗体
  抗核抗体：抗核抗体とは細胞の核の中にある抗原物質に対する抗体群の総称です。抗核抗体が陽性の場合､膠原病（進行性全身性硬化症、多発性筋炎、シェーグレン症候群）や慢性関節リウマチなどの疾患の可能性があります。
• 抗ミトコンドリア抗体
  細胞を構成するミトコンドリアを抗原とする抗体で、抗ミトコンドリア抗体が陽性の場合、自己免疫の異常によって肝臓の中に胆汁がうっ滞する疾患である原発性胆汁性肝硬変などの疾患の可能性があります。

• 免疫電気泳動
• 免疫複合体
• 抗核抗体
• 抗ＤＮＡ抗体
• 抗血小板抗体
• 抗平滑筋抗体
• 免疫グロブリン定量
• 栄養指標

血液中に含まれる細胞の数を調べたり、白血病細胞などの有無を調べる検査です。白血球の増減は細菌感染症、赤血球数やヘモグロビン量は貧血、好酸球数はアレルギーの診断に使われます。

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血液が凝固する機能を調べる検査です。具体的には患者さんの耳たぶに針を刺し、血が止まる時間を計ります。

骨髄穿刺した骨髄を染色したり、白血病の細胞の染色体を調べて遺伝子の異常の有無を調べる検査などがあります。

腫瘍の一部を採取して切り出し→包埋→薄切→染色 の工程で作製した組織標本を、病理医が組織学的に顕微鏡で観察します。良性か悪性だけでなく、特殊な疾患（潰瘍性大腸炎、結核、アミロイドーシスなど）の有無や炎症の原因などを合わせて調べます。検査材料は外科手術で採取するだけでなく、針や鉗子などをつかって得られる小さな組織片でも扱えます。
数値によるデータや画像診断等の間接的検査とは異なり、病変部を直視診断する検査であり、多くの場合は最終的確定診断となります。

膣内容物、喀痰、尿などから細胞を採取します。採取した細胞は塗抹→固定→染色の工程を経て細胞診標本を作製します。顕微鏡で個々の細胞を観察し、どのような細胞で構成されているのか、患部の病変は何かを細胞学的に診断して判定します。
主にがん細胞の有無を観察しますが、細胞採取のときに患者に恐れや苦痛を与えず比較的簡単に繰り返して検査を行えるため、悪性病変のスクリーニングや術後の経過観察などで利用され、病理組織検査の補助的な役割もあります。

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便の中に虫卵を排出する寄生虫は、直接薄層塗抹法や集卵法により、便を顕微鏡で観察し、卵や虫体を検出します。便を肉眼で観察して、寄生虫を発見する場合もあります。ある種類の寄生虫がいると、便のなかに白い片節があったり、ぎょう虫の場合は表面に糸屑のような成虫が付着しているときがあります。

ぎょう虫は夜中に肛門付近に産卵します。特殊なセロハンテープを肛門に貼って、これで採取した卵を顕微鏡で観察します。

便のなかに寄生虫やその卵が発見できない場合に有効な方法が、血液を調べる免疫学的検査です。血液の感染に対する体内の免疫反応を調べます。

栄養状態、病態を知るためのスクリーニング検査で、血清中の蛋白の内容を分類したものです。肝臓病や腎臓病がわかります。

血液を採取して、血液中に含まれる成分を調べ、肝臓の働きや肝臓病を診断する検査のことです。　肝機能検査の代表的な検査項目にGOT、GPTがあります。

タンパク尿や頻尿など尿や排尿に異常があるときや、浮腫や高血圧など腎臓疾患によると思われる症状があるときに行います。

体液中のイオン濃度を測定し、バランスの崩れを調べて体内の障害を診断します。また、腎障害の疑いがあるときにも実施します。

分泌機能の状態を知るために、血液や尿中のホルモンやその代謝産物を測定する検査です。分泌されたホルモンそのものの異常のほかに、ホルモンを産生する臓器の異常や、ホルモンの産生を調節する別のホルモンの異常、そのホルモンが標的とする臓器の異常などが分かります。

感染症を起こす微生物の遺伝子を検出する検査です。人に感染し、病気を発症する微生物を病原微生物と言いますが、この病原微生物の種類や量を調べることにより、どのような微生物に感染しているのか、どのような薬が効くのかが分かります。

親から子へ遺伝する遺伝子変化がもとになってひきおこされる遺伝病や、胎児の状態を調べる出生診断、糖尿病や肥満の原因解明などの遺伝学的検査と、遺伝子が関係しているといわれている白血病や癌などを調べる体細胞遺伝子検査があります。
遺伝子検査と言えば、ドラマなどでよく目にする親子鑑定や犯人を特定する個人識別などが有名ですが、親子鑑定などの法医学的検査は一般の医療では行わないため遺伝子関連検査の対象外とされています。